ב22 ביוני 1941 – לצד הצבא הגרמני – גם הצבא הרומני תוקף את ברית המועצות בחלק הדרומי של החזית. הרומנים שאפו לחזיר לידם את הגדה המערבית של הנהר דנייסטר – ולשלוט מחדש על שטחי בסרביה ובוקובינה הצפונית שנלקחו מהם בקיץ 1940 בידי הסובייטים. בסוף אוגוסט 1941 מקבלת ממשלת רומניה מהגרמנים אחריות על האזורים בגדה המזרחית של הנהר דנייסטר – ניסטרו ברומנית. השם שניתן לאזור זה על ידי היטלר – טרנסניסטריה.
הסרט “מעבר לניסטרו” מתאר חלק מאירועי השואה, שהתרחשו בשנה הראשונה של המלחמה הפטריוטית הגדולה בשטחי ברית המועצות שנשלטו על ידי רומניה. פרקי הסרט מגוללים את סיפור הסבל והמוות של מאות אלפי יהודים – קורבנות השואה שחוללו הרומנים. הסרט כולל שלושה פרקים:
פרק 1 – נקמת הרומנים – מדבר על הפוגרומים ועל רצח היהודים במולדובה (בסרביה) מתחילת מבצע ברברוסה ב – 22/6/1941 ולפני גירוש היהודים מבסרביה ובוקובינה לטרנסניסטריה.
פרק 2 – פוריפיקציה (טיהור) – מתאר את גירוש היהודים מצ’רנוביץ’ ומקומות נוספים בבוקובינה – ודרך הסבל והמוות עד הגיעם לגטאות טרנסניסטריה.
פרק 3 – מכת הטיפוס – חורף 1941/42 בגטאות ברשד ושארגורוד – מותם של עשרות אלפי יהודים ממחלת הטיפוס, מקור מצמית ומרעב.